Riepilogo e Programma
Questa è una nuova lezione costruita con The Carpentries Workbench.
| Istruzioni di Configurazione | Scarica i file richiesti per la lezione | |
| Duration: 00h 00m | 1. Esecuzione di comandi con Snakemake | “Come si esegue un semplice comando con Snakemake?” |
| Duration: 01h 00m | 2. Esecuzione di Snakemake sul cluster | “Come si esegue la mia regola di Snakemake nel cluster?” |
| Duration: 01h 50m | 3. Segnaposto | “Come si crea una regola generica?” |
| Duration: 03h 00m | 4. Applicazioni MPI e Snakemake | “Come si esegue un’applicazione MPI tramite Snakemake sul cluster?” |
| Duration: 03h 50m | 5. Concatenazione di regole |
“Come si combinano le regole in un flusso di lavoro?” “Come faccio a creare una regola con più ingressi e uscite?” |
| Duration: 05h 00m | 6. Elaborazione di elenchi di input |
“Come posso elaborare più file contemporaneamente?” “Come si combinano più file insieme?” |
| Duration: 06h 20m | Fine |
L'orario effettivo può variare leggermente a seconda degli argomenti e degli esercizi scelti dall'istruttore.
FISSO: le istruzioni per l’installazione sono contenute in questo documento. Specificare gli strumenti e i set di dati che l’allievo deve avere installato.
Insiemi di dati
Scaricare il file zip dei dati e decomprimerlo sul Desktop
Configurazione del software
Dettagli
Le impostazioni per i diversi sistemi possono essere presentate in
menu a discesa tramite un tag solution. Essi si uniranno a
questo blocco di discussione, quindi è possibile fornire una panoramica
generale del software utilizzato in questa lezione qui e compilare i
singoli sistemi operativi (e potenzialmente aggiungerne altri, ad
esempio la configurazione online) nei blocchi delle soluzioni.
Utilizzare PuTTY
Utilizzare Terminal.app
Utilizzare il Terminale