Navigazione tra file e directory

Panoramica

Domande

• Come posso muovermi nel mio computer?
• Come posso vedere quali file e cartelle ci sono?
• Come posso specificare la posizione di un file o di una cartella sul mio computer?

Obiettivi

• Spiegare le somiglianze e le differenze tra un file e una directory.
• Tradurre un percorso assoluto in un percorso relativo e viceversa.
• Costruire percorsi assoluti e relativi che identificano file e cartelle specifici.
• Usare opzioni e argomenti per modificare il comportamento di un comando di shell.
• Dimostrare l’uso del completamento a schede e spiegarne i vantaggi.

La parte del sistema operativo responsabile della gestione dei file e delle directory si chiama file system. Organizza i dati in file, che contengono informazioni, e cartelle, che contengono file o altre cartelle.

Diversi comandi sono usati frequentemente per creare, ispezionare, rinominare e cancellare file e cartelle. Per iniziare a esplorarli, andiamo alla nostra finestra di shell aperta.

Per prima cosa, scopriamo dove ci troviamo eseguendo un comando chiamato pwd (che sta per ‘print working directory’). Le directory sono come luoghi: in qualsiasi momento, mentre si utilizza la shell, ci si trova esattamente in un luogo chiamato current working directory. I comandi leggono e scrivono i file nella directory di lavoro corrente, cioè “qui”, quindi è importante sapere dove ci si trova prima di eseguire un comando. pwd mostra la posizione in cui ci si trova:

BASH

$ pwd

OUTPUT

/Users/nelle

Qui, la risposta del computer è /Users/nelle, che è la home directory di Nelle:

Richiamo

Variazione della directory principale

Il percorso della home directory ha un aspetto diverso nei diversi sistemi operativi. Su Linux, può apparire come /home/nelle, mentre su Windows sarà simile a C:\Documents and Settings\nelle o C:\Users\nelle. (Negli esempi futuri, abbiamo utilizzato l’output del Mac come predefinito; l’output di Linux e Windows può differire leggermente, ma dovrebbe essere generalmente simile.

Si suppone inoltre che il comando pwd restituisca la home directory dell’utente. Se pwd restituisce qualcosa di diverso, potrebbe essere necessario navigare lì usando cd o alcuni comandi di questa lezione non funzioneranno come scritto. Vedere Esplorare altre directory per maggiori dettagli sul comando cd.

Per capire che cos’è una “cartella home”, diamo un’occhiata a come è organizzato il file system nel suo complesso. Per il bene di questo esempio, illustreremo il filesystem del computer della nostra scienziata Nelle. Dopo questa illustrazione, imparerete i comandi per esplorare il vostro filesystem, che sarà costruito in modo simile, ma non esattamente identico.

Sul computer di Nelle, il filesystem ha questo aspetto:

Il filesystem ha l’aspetto di un albero capovolto. La cartella più in alto è la cartella di root che contiene tutto il resto. Ci si riferisce ad essa usando un carattere slash, /, da solo; questo carattere è lo slash iniziale di /Users/nelle.

All’interno di questa cartella ci sono diverse altre cartelle: bin (dove sono memorizzati alcuni programmi integrati), data (per i file di dati vari), Users (dove si trovano le cartelle personali degli utenti), tmp (per i file temporanei che non devono essere memorizzati a lungo) e così via.

Sappiamo che la nostra cartella di lavoro corrente /Users/nelle è memorizzata all’interno di /Users perché /Users è la prima parte del suo nome. Allo stesso modo, sappiamo che /Users è memorizzata nella cartella principale / perché il suo nome inizia con /.

Richiamo

Slash

Si noti che il carattere / ha due significati. Quando compare davanti al nome di un file o di una cartella, si riferisce alla cartella principale. Quando appare all’interno di un percorso, è solo un separatore.

Sotto /Users, troviamo una directory per ogni utente con un account sulla macchina di Nelle, i suoi colleghi imhotep e larry.

I file dell’utente imhotep sono memorizzati in /Users/imhotep, quelli dell’utente larry in /Users/larry e quelli di Nelle in /Users/nelle. Nelle è l’utente degli esempi; pertanto, la nostra cartella home è /Users/nelle. In genere, quando si apre un nuovo prompt dei comandi, all’inizio ci si trova nella propria cartella home.

Ora impariamo il comando che ci permetterà di vedere il contenuto del nostro filesystem. Possiamo vedere cosa c’è nella nostra cartella home eseguendo ls:

BASH

$ ls

OUTPUT

Applications Documents    Library      Music        Public
Desktop      Downloads    Movies       Pictures

(Anche in questo caso, i risultati possono essere leggermente diversi a seconda del sistema operativo e di come è stato personalizzato il filesystem)

ls stampa i nomi dei file e delle cartelle nella cartella corrente. È possibile rendere il suo output più comprensibile utilizzando l’opzione -F **che indica a ls di classificare l’output aggiungendo un marcatore ai nomi dei file e delle cartelle per indicare di cosa si tratta:

• il trattino / indica che si tratta di una directory
• @ indica un link
• * indica un eseguibile

A seconda delle impostazioni predefinite della shell, questa potrebbe anche utilizzare dei colori per indicare se ogni voce è un file o una cartella.

BASH

$ ls -F

OUTPUT

Applications/ Documents/    Library/      Music/        Public/
Desktop/      Downloads/    Movies/       Pictures/

Qui possiamo vedere che la cartella home contiene solo sottocartelle. Tutti i nomi nell’output che non hanno un simbolo di classificazione sono file nella cartella di lavoro corrente.

Richiamo

Cancellazione del terminale

Se lo schermo è troppo ingombro, si può cancellare il terminale con il comando clear. È comunque possibile accedere ai comandi precedenti usando ↑ e ↓ per spostarsi riga per riga, oppure scorrendo il terminale.

Ottenere aiuto

ls ha molte altre opzioni. Ci sono due modi comuni per scoprire come usare un comando e quali opzioni accetta — a seconda del vostro ambiente, potreste scoprire che solo uno di questi modi funziona:

1. possiamo passare un’opzione --help a qualsiasi comando (disponibile su Linux e Git Bash), ad esempio:

BASH

$ ls --help

2. possiamo leggere il suo manuale con man (disponibile su Linux e macOS):

BASH

$ man ls

descriveremo entrambi i modi in seguito.

Richiamo

Guida per i comandi incorporati

Alcuni comandi sono integrati nella shell Bash, anziché esistere come programmi separati nel filesystem. Un esempio è il comando cd (cambio di directory). Se si riceve un messaggio come No manual entry for cd, provare invece help cd. Il comando help è il modo per ottenere informazioni sull’uso di Bash built-ins.

L’opzione --help è stata utilizzata per elencare i contenuti della cartella di lavoro corrente

La maggior parte dei comandi di bash e dei programmi scritti per essere eseguiti all’interno di bash supportano un’opzione --help che mostra ulteriori informazioni su come utilizzare il comando o il programma.

BASH

$ ls --help

OUTPUT

Usage: ls [OPTION]... [FILE]...
List information about the FILEs (the current directory by default).
Sort entries alphabetically if neither -cftuvSUX nor --sort is specified.

Mandatory arguments to long options are mandatory for short options, too.
  -a, --all                  do not ignore entries starting with .
  -A, --almost-all           do not list implied . and ..
      --author               with -l, print the author of each file
  -b, --escape               print C-style escapes for nongraphic characters
      --block-size=SIZE      scale sizes by SIZE before printing them; e.g.,
                               '--block-size=M' prints sizes in units of
                               1,048,576 bytes; see SIZE format below
  -B, --ignore-backups       do not list implied entries ending with ~
  -c                         with -lt: sort by, and show, ctime (time of last
                               modification of file status information);
                               with -l: show ctime and sort by name;
                               otherwise: sort by ctime, newest first
  -C                         list entries by columns
      --color[=WHEN]         colorize the output; WHEN can be 'always' (default
                               if omitted), 'auto', or 'never'; more info below
  -d, --directory            list directories themselves, not their contents
  -D, --dired                generate output designed for Emacs' dired mode
  -f                         do not sort, enable -aU, disable -ls --color
  -F, --classify             append indicator (one of */=>@|) to entries
...        ...        ...

Richiamo

Quando usare le opzioni brevi o lunghe

Quando le opzioni esistono sia come opzioni brevi che lunghe:

• Usare l’opzione breve quando si digitano comandi direttamente nella shell per ridurre al minimo la pressione dei tasti e svolgere più rapidamente il proprio compito.
• Usate l’opzione long negli script per fornire chiarezza. Verrà letto molte volte e digitato una sola volta.

Richiamo

Opzioni della riga di comando non supportate

Se si cerca di usare un’opzione non supportata, ls e altri comandi di solito stampano un messaggio di errore simile a:

BASH

$ ls -j

ERRORE

ls: invalid option -- 'j'
Try 'ls --help' for more information.

Il comando man

L’altro modo per conoscere ls è digitare

BASH

$ man ls

Questo comando trasformerà il vostro terminale in una pagina con una descrizione del comando ls e delle sue opzioni.

Per navigare tra le pagine di man, si possono usare ↑ e ↓ per spostarsi riga per riga, oppure provare b e Spacebar per saltare su e giù di una pagina intera. Per cercare un carattere o una parola nelle pagine di man, usare / seguito dal carattere o dalla parola che si sta cercando. A volte una ricerca produce più risultati. In tal caso, è possibile spostarsi tra i risultati utilizzando N (per andare avanti) e Shift+N (per andare indietro).

Per uscire dalle pagine man, premere q.

Richiamo

Pagine di manuale sul web

Naturalmente, esiste un terzo modo per accedere alla guida dei comandi: la ricerca su Internet tramite il browser. Quando si utilizza la ricerca su Internet, includere la frase unix man page nella query di ricerca aiuterà a trovare risultati pertinenti.

GNU fornisce collegamenti ai suoi manuali, compreso il core GNU utilities, che copre molti comandi introdotti in questa lezione.

Sfida

Esplorazione di altre opzioni ls

È anche possibile utilizzare due opzioni contemporaneamente. Cosa fa il comando ls quando viene usato con l’opzione -l? E se si utilizzano sia l’opzione -l che l’opzione -h?

Alcuni dei suoi risultati riguardano proprietà che non vengono trattate in questa lezione (come i permessi e la proprietà dei file), ma il resto dovrebbe essere comunque utile.

Soluzione

L’opzione -l fa sì che ls utilizzi un formato di elenco llungo, mostrando non solo i nomi dei file/directory ma anche informazioni aggiuntive, come la dimensione del file e l’ora dell’ultima modifica. Se si usano sia l’opzione -h che l’opzione -l, si rende la dimensione del file “leggibile dall’uomo”, cioè si visualizza qualcosa come 5.3K invece di 5369.

Sfida

Elenco in ordine cronologico inverso

Per impostazione predefinita, ls elenca il contenuto di una cartella in ordine alfabetico per nome. Il comando ls -t elenca gli elementi in base all’ora dell’ultima modifica invece che in ordine alfabetico. Il comando ls -r elenca il contenuto di una cartella in ordine inverso. Quale file viene visualizzato per ultimo quando si combinano le opzioni -t e -r? Suggerimento: Potrebbe essere necessario usare l’opzione -l per vedere le ultime date di modifica.

Soluzione

Il file modificato più di recente è elencato per ultimo quando si usa -rt. Questo può essere molto utile per trovare le modifiche più recenti o per verificare se è stato scritto un nuovo file di output.

Esplorazione di altre cartelle

Non solo si può usare ls sulla cartella di lavoro corrente, ma anche per elencare il contenuto di una cartella diversa. Diamo un’occhiata alla nostra cartella Desktop eseguendo ls -F Desktop, cioè il comando ls con la opzione -F e l’[argomento][Argomenti] Desktop. L’argomento Desktop indica a ls che si vuole un elenco di qualcosa di diverso dalla cartella di lavoro corrente:

BASH

$ ls -F Desktop

OUTPUT

shell-lesson-data/

Si noti che se una cartella denominata Desktop non esiste nella cartella di lavoro corrente, questo comando restituirà un errore. In genere, una cartella Desktop esiste nella propria home directory, che si presume sia la cartella di lavoro corrente della shell bash.

L’output dovrebbe essere un elenco di tutti i file e le sottocartelle della vostra cartella Desktop, compresa la cartella shell-lesson-data che avete scaricato nel setup per questa lezione. (Nella maggior parte dei sistemi, il contenuto della cartella Desktop nella shell viene visualizzato come icona in un’interfaccia grafica dietro tutte le finestre aperte. Verificate se questo è il vostro caso)

Organizzare le cose in modo gerarchico ci aiuta a tenere traccia del nostro lavoro. Sebbene sia possibile mettere centinaia di file nella nostra cartella home, così come è possibile ammassare centinaia di fogli stampati sulla nostra scrivania, è molto più facile trovare le cose quando sono organizzate in sottocartelle con nomi ragionevoli.

Ora che sappiamo che la cartella shell-lesson-data si trova nella nostra cartella Desktop, possiamo fare due cose.

Per prima cosa, usando la stessa strategia di prima, possiamo esaminare il suo contenuto passando il nome di una cartella a ls:

BASH

$ ls -F Desktop/shell-lesson-data

OUTPUT

exercise-data/  north-pacific-gyre/

In secondo luogo, possiamo cambiare la nostra posizione in una cartella diversa, in modo da non trovarci più nella nostra cartella home.

Il comando per cambiare posizione è cd seguito da un nome di cartella per cambiare la nostra cartella di lavoro. cd sta per ‘change directory’, il che è un po’ fuorviante. Il comando non cambia la cartella, ma la cartella di lavoro corrente della shell. In altre parole, cambia le impostazioni della shell per quanto riguarda la cartella in cui ci troviamo. Il comando cd è simile a un doppio clic su una cartella in un’interfaccia grafica per entrare in quella cartella.

Supponiamo di volerci spostare nella cartella exercise-data che abbiamo visto sopra. Per arrivarci possiamo usare la seguente serie di comandi:

BASH

$ cd Desktop
$ cd shell-lesson-data
$ cd exercise-data

Questi comandi ci spostano dalla nostra cartella home alla nostra cartella Desktop, poi alla cartella shell-lesson-data, quindi alla directory exercise-data. Si noterà che cd non stampa nulla. Questo è normale. Molti comandi di shell non producono nulla sullo schermo quando vengono eseguiti con successo. Ma se si esegue pwd dopo di esso, si può vedere che ora ci troviamo in /Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data/exercise-data.

Se ora si esegue ls -F senza argomenti, viene elencato il contenuto di /Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data/exercise-data, perché è lì che ci troviamo:

BASH

$ pwd

OUTPUT

/Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data/exercise-data

BASH

$ ls -F

OUTPUT

alkanes/  animal-counts/  creatures/  numbers.txt  writing/

Ora sappiamo come scendere nell’albero delle cartelle (cioè come entrare in una sottocartella), ma come salire (cioè come lasciare una cartella e andare nella sua cartella home)? Potremmo provare a fare come segue:

BASH

$ cd shell-lesson-data

ERRORE

-bash: cd: shell-lesson-data: No such file or directory

ma si ottiene un errore! Perché?

Con i metodi utilizzati finora, cd può vedere solo le sottocartelle all’interno della cartella corrente. Esistono diversi modi per vedere le cartella al di sopra della posizione corrente; inizieremo con il più semplice.

Esiste una scorciatoia nella shell per spostarsi su un livello di cartella. Funziona come segue:

BASH

$ cd ..

.. è un nome speciale di cartella che significa “la cartella che contiene questa”, o più brevemente, il genitore della cartella corrente. Sicuramente, se si esegue pwd dopo aver eseguito cd .., ci si ritrova in /Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data:

BASH

$ pwd

OUTPUT

/Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data

La cartella speciale .. di solito non viene visualizzata quando si esegue ls. Se si desidera visualizzarla, si può aggiungere l’opzione -a a ls -F:

BASH

$ ls -F -a

OUTPUT

./  ../  exercise-data/  north-pacific-gyre/

-a sta per “mostra tutto” (compresi i file nascosti); obbliga ls a mostrare i nomi dei file e delle cartella che iniziano con ., come ad esempio .. (che, se ci troviamo in /Users/nelle, si riferisce alla cartella /Users). Come si può vedere, viene visualizzata anche un’altra cartella speciale, chiamata ., che significa “la cartella di lavoro corrente”. Può sembrare superfluo avere un nome per questa cartella, ma presto ne vedremo l’uso.

Si noti che nella maggior parte degli strumenti a riga di comando, più opzioni possono essere combinate con un singolo - e senza spazi tra le opzioni; ls -F -a è equivalente a ls -Fa.

Richiamo

Altri file nascosti

Oltre alle cartella nascoste .. e ., è possibile che venga visualizzato anche un file chiamato .bash_profile. Questo file contiene solitamente le impostazioni di configurazione della shell. Si possono vedere anche altri file e cartella che iniziano con .. Si tratta in genere di file e cartella utilizzati per configurare diversi programmi sul computer. Il prefisso . è usato per evitare che questi file di configurazione ingombrino il terminale quando si usa il comando standard ls.

Questi tre comandi sono i comandi di base per navigare nel filesystem del computer: pwd, ls e cd. Esploriamo alcune variazioni di questi comandi. Cosa succede se si digita cd da solo, senza indicare una directory?

BASH

$ cd

Come si può controllare cosa è successo? pwd ci dà la risposta!

BASH

$ pwd

OUTPUT

/Users/nelle

Si scopre che cd senza un argomento vi riporterà alla vostra cartella home, il che è ottimo se vi siete persi nel vostro filesystem.

Proviamo a tornare alla cartella exercise-data di prima. L’ultima volta abbiamo usato tre comandi, ma possiamo mettere insieme l’elenco delle cartella per spostarci a exercise-data in un solo passaggio:

BASH

$ cd Desktop/shell-lesson-data/exercise-data

Verificare che ci si sia spostati nel posto giusto eseguendo pwd e ls -F.

Se si vuole salire di un livello dalla cartella dei dati, si può usare cd ... Ma c’è un altro modo per spostarsi in qualsiasi cartella, indipendentemente dalla posizione attuale.

Finora, quando si sono specificati i nomi delle cartella, o anche un percorso di cartella (come sopra), si sono usati percorsi relativi. Quando si usa un percorso relativo con un comando come ls o cd, si cerca di trovare quella posizione dal punto in cui ci si trova, piuttosto che dalla radice del file system.

Tuttavia, è possibile specificare il percorso assoluto di una cartella includendo il suo intero percorso a partire dalla cartella principale, indicata da una barra iniziale. La barra iniziale / indica al computer di seguire il percorso dalla radice del file system, in modo da riferirsi sempre esattamente a una cartella, indipendentemente dalla posizione in cui ci si trova quando si esegue il comando.

Questo ci permette di spostarci nella nostra cartella shell-lesson-data da qualsiasi punto del filesystem (anche da dentro exercise-data). Per trovare il percorso assoluto che stiamo cercando, possiamo usare pwd e poi estrarre il pezzo che dobbiamo spostare in shell-lesson-data.

BASH

$ pwd

OUTPUT

/Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data/exercise-data

BASH

$ cd /Users/nelle/Desktop/shell-lesson-data

Eseguire pwd e ls -F per assicurarsi di essere nella directory prevista.

Richiamo

Altre due scorciatoie

La shell interpreta il carattere tilde (~) all’inizio di un percorso come “la cartella home dell’utente corrente”. Ad esempio, se la cartella home di Nelle è /Users/nelle, allora ~/data è equivalente a /Users/nelle/data. Questo funziona solo se è il primo carattere del percorso; here/there/~/elsewhere è non here/there/Users/nelle/elsewhere.

Un’altra scorciatoia è il carattere - (trattino).cd tradurrà - in la cartella precedente in cui mi trovavo, il che è più veloce che dover ricordare, e poi digitare, il percorso completo. Questo è un modo molto efficiente di spostarsi avanti e indietro tra due cartella – cioè se si esegue cd - due volte, si torna alla cartella di partenza.

La differenza tra cd .. e cd - è che il primo porta su, mentre il secondo porta indietro.

---

Provate! Per prima cosa spostatevi in ~/Desktop/shell-lesson-data (dovreste essere già lì).

BASH

$ cd ~/Desktop/shell-lesson-data

Poi cd nella cartella exercise-data/creatures

BASH

$ cd exercise-data/creatures

ora se si esegue

BASH

$ cd -

vedrete che siete tornati in ~/Desktop/shell-lesson-data. Eseguite di nuovo cd - e sarete di nuovo in ~/Desktop/shell-lesson-data/exercise-data/creatures

Sfida

Percorsi assoluti e relativi

Partendo da /Users/nelle/data, quale dei seguenti comandi potrebbe essere usato da Nelle per navigare verso la sua cartella home, che è /Users/nelle?

1. cd .
2. cd /
3. cd /home/nelle
4. cd ../..
5. cd ~
6. cd home
7. cd ~/data/..
8. cd
9. cd ..

Soluzione

1. No: . sta per la cartella corrente.
2. No: / sta per la cartella principale.
3. No: la cartella home di Nelle è /Users/nelle.
4. No: questo comando sale di due livelli, cioè termina con /Users.
5. Sì: ~ sta per la cartella home dell’utente, in questo caso /Users/nelle.
6. No: questo comando naviga in una cartella home nella cartella corrente, se esiste.
7. Sì: inutilmente complicato, ma corretto.
8. Sì: scorciatoia per tornare alla cartella principale dell’utente.
9. Sì: sale di un livello.

Sfida

Risoluzione del percorso relativo

Utilizzando il diagramma del filesystem qui sotto, se pwd visualizza /Users/thing, cosa visualizzerà ls -F ../backup?

1. ../backup: No such file or directory
2. 2012-12-01 2013-01-08 2013-01-27
3. 2012-12-01/ 2013-01-08/ 2013-01-27/
4. original/ pnas_final/ pnas_sub/

Soluzione

1. No: c’è *una cartella backup in /Users.
2. No: questo è il contenuto di Users/thing/backup, ma con .., abbiamo chiesto un livello più in alto.
3. No: vedi spiegazione precedente.
4. Sì: ../backup/ si riferisce a /Users/backup/.

Sfida

ls Comprensione della lettura

Utilizzando il diagramma del filesystem qui sotto, se pwd visualizza /Users/backup e -r dice a ls di visualizzare le cose in ordine inverso, quale/i comando/i produrrà il seguente output:

OUTPUT

pnas_sub/ pnas_final/ original/

1. ls pwd
2. ls -r -F
3. ls -r -F /Users/backup

Soluzione

1. No: pwd non è il nome di una cartella.
2. Sì: ls senza l’argomento cartella elenca i file e le directory nella directory corrente.
3. Sì: utilizza esplicitamente il percorso assoluto.

Sintassi generale di un comando di Shell

---

Abbiamo già incontrato comandi, opzioni e argomenti, ma forse è utile formalizzare un po’ di terminologia.

Considerate il comando qui sotto come un esempio generale di comando, che verrà sezionato nelle sue parti componenti:

BASH

$ ls -F /

ls è il comando, con una opzione -F e un argomento /. Abbiamo già incontrato opzioni che iniziano con un solo trattino (-), note come opzioni corte, o con due trattini (--), note come opzioni lunghe. le [Opzioni] modificano il comportamento di un comando e gli [Argomenti] indicano al comando su cosa operare (ad esempio, file e cartella). A volte le opzioni e gli argomenti sono indicati come parametri. Un comando può essere chiamato con più di un’opzione e più di un argomento, ma non sempre un comando richiede un argomento o un’opzione.

A volte si può vedere che le opzioni vengono chiamate scambi o flags, specialmente per le opzioni che non richiedono argomenti. In questa lezione useremo il termine opzione.

Ogni parte è separata da spazi. Se si omette lo spazio tra ls e -F la shell cercherà un comando chiamato ls-F, che non esiste. Inoltre, la capitalizzazione può essere importante. Ad esempio, ls -s visualizzerà la dimensione dei file e delle cartella accanto ai nomi, mentre ls -S ordinerà i file e le cartella per dimensione, come mostrato di seguito:

BASH

$ cd ~/Desktop/shell-lesson-data
$ ls -s exercise-data

OUTPUT

total 28
 4 animal-counts   4 creatures  12 numbers.txt   4 alkanes   4 writing

Si noti che le dimensioni restituite da ls -s sono in blocchi. Poiché queste sono definite in modo diverso per i diversi sistemi operativi, è possibile che non si ottengano le stesse cifre dell’esempio.

BASH

$ ls -S exercise-data

OUTPUT

animal-counts  creatures  alkanes  writing  numbers.txt

Mettendo insieme tutti questi elementi, il comando ls -F / di cui sopra fornisce un elenco di file e cartella nella cartella principale /. Di seguito è riportato un esempio dell’output che si potrebbe ottenere dal comando precedente:

BASH

$ ls -F /

OUTPUT

Applications/         System/
Library/              Users/
Network/              Volumes/

Pipeline di Nelle: Organizzare i file

sapendo queste informazioni su file e cartella, Nelle è pronta a organizzare i file che la macchina per il saggio delle proteine creerà.

Crea una cartella chiamata north-pacific-gyre (per ricordarsi da dove provengono i dati), che conterrà i file di dati della macchina di analisi e i suoi script di elaborazione dei dati.

Ogni campione fisico è etichettato secondo la convenzione del suo laboratorio con un ID unico di dieci caratteri, ad esempio “NENE01729A”. Questo ID viene utilizzato nel registro di raccolta per registrare la posizione, l’ora, la profondità e altre caratteristiche del campione, quindi decide di utilizzarlo nel nome di ogni file di dati. Poiché l’output della macchina di analisi è un testo semplice, chiamerà i suoi file NENE01729A.txt, NENE01812A.txt e così via. Tutti i 1520 file andranno nella stessa directory.

Ora nella sua cartella corrente shell-lesson-data, Nelle può vedere quali file ha usando il comando:

BASH

$ ls north-pacific-gyre/

Questo comando è molto impegnativo da digitare, ma si può lasciare che la shell faccia la maggior parte del lavoro attraverso il cosiddetto completamento delle tabelle. Se si digita:

BASH

$ ls nor

e poi preme Tab (il tasto tab della tastiera), la shell completa automaticamente il nome della cartella:

BASH

$ ls north-pacific-gyre/

Premendo di nuovo Tab non si ottiene nulla, poiché ci sono più possibilità; premendo Tab due volte si ottiene un elenco di tutti i file.

Se Nelle preme G e poi di nuovo Tab, la shell aggiungerà ‘goo’ poiché tutti i file che iniziano con ‘g’ condividono i primi tre caratteri ‘goo’.

BASH

$ ls north-pacific-gyre/goo

per vedere tutti quei file, si può premere Tab altre due volte.

BASH

ls north-pacific-gyre/goo
goodiff.sh   goostats.sh

questo si chiama completamento delle tabelle e lo vedremo in molti altri strumenti man mano che andremo avanti.

Punti Chiave

• Il file system è responsabile della gestione delle informazioni sul disco.
• Le informazioni sono memorizzate in file, che sono memorizzati in cartelle.
• le cartelle possono anche memorizzare altre cartelle, che formano un albero di cartelle.
• pwd stampa la cartella di lavoro corrente dell’utente.
• ls [path] stampa un elenco di uno specifico file o cartella; ls da solo elenca la cartella di lavoro corrente.
• cd [path] cambia la cartella di lavoro corrente.
• La maggior parte dei comandi accetta opzioni che iniziano con un singolo -.
• i nomi delle cartelle in un percorso sono separati con / su Unix, ma \ su Windows.
• / da sola è la cartella principale dell’intero file system.
• Un percorso assoluto specifica una posizione dalla radice del file system.
• Un percorso relativo specifica una posizione a partire da quella corrente.
• . da solo significa “la cartella corrente”; .. significa “la cartella sopra quella corrente”.